לימודי הגמרא תופסים מקום נכבד בבית ספרינו. החל מכיתה ד' לומדים הילדים גמרא עם רש"י, תוספות, ראשונים ואחרונים. בכיתות ה' ו' לומדים 5 שעות שבועיות במסכתות ברכות וקידושין.
אנו שואפים לכך שתלמידינו ובוגרינו יחושו קרבה לדף הגמרא כפי שלמדו אבותינו מתקופת האמוראים ולכך אנו משקיעים רבות בשינון המילים בארמית וכן במונחי יסוד ההכרחיים להבנת הסוגיות בגמרא.
שמחנו מאוד השנה על חידוש וחזרה לפרוייקט המאתגר "תורה לשמה" המתקיים ב"דעת- מבינים" שנים רבות. בימי שלישי בשעה 7:30 בבוקר, לפני תחילת יום הלימודים, מגיעים תלמידי כיתות ה'-ו' מתוך נכונות ובחירה ללמוד מסכת "תענית" מכריכה לכריכה.
בנות שכבות ה'-ו' מגיעות מידי יום שישי בשעה 7:40 ללימוד עם רב בית הספר בנושאים מגוונים. ב"ה ההיענות מצד התלמידים והתלמידות הייתה מרגשת מאוד. אי אפשר להתרגל למראה ילדים הבאים מרצונם ובזמנם החופשי ללמוד תורה.
שכבת ו׳ חווים כל כמה שבועות תפילה במניין בבית הכנסת ״אור חדש יאיר״. התפילה המשותפת בבית הכנסת מהווה נדבך נוסף בהכנתם לחיים תורניים.